数据准备

测试数据下载

数据集1

• 试剂版本：SeekSpace® 单细胞空间转录组试剂盒V1.1版本（DDVA）

• 物种信息：小鼠

• 组织类型：卵巢

• 芯片编号：2P241018012A2

测试数据 - md5: 35663411550cfdcd1b99fcd269b66bbc

wget下载方式

wget -c -O demo.tar "https://seekgene-public.oss-cn-beijing.aliyuncs.com/software/data/demodata/space/WTHA5.tar"
# decompress
tar xf WTHA5.tar

curl下载方式

curl -C - -o demo.tar "https://seekgene-public.oss-cn-beijing.aliyuncs.com/software/data/demodata/space/WTHA5.tar"
# decompress
tar xf WTHA5.tar

数据集2

• 试剂版本：SeekSpace® 单细胞空间转录组试剂盒V1.0版本 (DDVS)

• 物种信息：小鼠

• 组织类型：脑

• 芯片编号：2P231224030A4

测试数据 - md5: 208efa2d39d5190abec986e9b25aa685

wget下载方式

wget -c -O demo.tar "https://seekgene-public.oss-cn-beijing.aliyuncs.com/software/data/demodata/space/demo.tar"
# decompress
tar xf demo.tar

curl下载方式

curl -C - -o demo.tar "https://seekgene-public.oss-cn-beijing.aliyuncs.com/software/data/demodata/space/demo.tar"
# decompress
tar xf demo.tar

---

参考基因组下载和构建

Download-mouse-reference-mm10 - md5: 5d3f8ee65f75f8143ec88f77b1821fd8

wget下载方式

wget -c -O mm10.tar.gz "https://seekgene-public.oss-cn-beijing.aliyuncs.com/software/data/reference/mm10.tar.gz"
# decompress
tar -zxvf mm10.tar.gz

curl下载方式

curl -C - -o mm10.tar.gz "https://seekgene-public.oss-cn-beijing.aliyuncs.com/software/data/reference/mm10.tar.gz"
# decompress
tar -zxvf mm10.tar.gz

参考基因组的构建可以参考如何构建参考基因组？